Kietojo kūno optikos laboratorija (vadovas prof. habil. dr. A. Audzijonis) bendradarbiauja su Lenkijos Silezijos institutu, Vokietijos Karlsruje Taikomosios fizikos institutu, Teoriniai elektroninės struktūros ir optinių spektrų tyrimai pseudopotencialo metodu atlikti bendradarbiaujant su Rusijos Voronežo universitetu.

Prof. habil. dr. G.Gaigalo grupė bendradarbiauja su Krokuvos  Jogailos  universitetu  (Lenkija), Lundo ir Malmės universitetais (Švedija), Fudano universitetu (Kinija). Vyksta mokslinės stažuotės, dėstytojai bei studentai dalyvauja Erasmus mainų programoje.

Skystųjų kristalų laboratorija (vadovas prof. dr. R. Vaišnoras) bendradarbiauja su Notinghamo universitetu (Didžioji Britanija), Drezdeno ir Rhein-Waal universitetais (Vokietija),  Barselonos, Madrido, Saragosos, Vigo universitetais (Ispanija), Florencijos ir Urbino universitetais (Italija), Liublino ir Varšuvos Universitetais (Lenkija), Ukrainos MA žemų temperatūrų fizikos ir technikos institutu, Rusijos MA Jofės fizikos ir technikos institutu Sankt Peterburge.  Šiuo metu Skystųjų kristalų laboratorija dalyvauja mainų programoje su Saragosos ir Vigo universitetais (Ispanija).

Ultragarsinių mechanizmų laboratorija (vadovas prof. habil. dr. P. Vasiljevas) bendradarbiauja su Kinijos Nanjingo Aeronautokos universitetu bei Pietų Korėjos Seulo Mokslo ir technologijos Institutu, Vokietijos Paderborno universiteto Hans Nixdorf‘o  instituto Machatronikos ir dinamikos katedra ir Hanoverio (Vokietija) Vilhelmo Leibnico universiteto Dinamikos institutu. Vyksta mokslinės stažuotės, skaitomos paskaitos užsienio universitetų studentams.