Baltų proistorės katedra

Baltų pasaulis ir jo raida
Etnologija ir mokslo istorija lituanistikoje

Visuotinės istorijos katedra

Lietuvos ryšiai su užsienio šalimis nuo seniausiųjų laikų iki šių dienų
Visuotinė istorija Lietuvos kultūroje

Katalikų tikybos katedra

Biblistika
Krikščioniškoji antropologija
Religinio ugdymo metodologija

Lietuvos istorijos katedra

Taikomoji istorija (Lokalinės istorijos tyrimai)
Lietuvos parlamentarizmo istorija
XX a. Lietuvos istorijos mokslas

Istorijos didaktikos centras

Istorijos mokymo Lietuvoje raida
Istorijos mokymo inovacijos Lietuvoje ir Europos valstybėse